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许多药物可以由孕妇的血液经胎盘进入胎儿体内，直接对胎儿产生毒性作用，特别是在妊娠的头3个月，因受精卵正处于分化阶段，各系统还没有形成，正处于发育阶段，胚胎细胞受到化学药物的作用，就可能诱发遗传物质突变，导致胎儿畸形。例如四环素类药，尤其是四环素能抑制胎儿骨质合成，在妊娠早期使用四环素可致胎儿四肢畸形，先天性白内障，妊娠4个月以后使用可致胎儿骨骼和牙齿发育障碍；卡那霉素、庆大霉素、链霉素可使胎儿听神经受到损伤，造成先天性耳聋；解热镇痛药阿司匹林、氨基比林等可造成胎儿中枢神经系统和肾脏畸形；大剂量皮质激素（强的松）可制胎儿多发性畸形，如唇裂和腭裂。性激素可致胎儿内分泌改变，如丙酸睾妨素可使女性胎儿外生殖器男性化；镇静药（冬眠灵、奋乃静等），抗过敏药（扑尔敏、苯海拉明等），利尿药（双氢克尿塞等），滴鼻净的长期应用，都可致胎儿神经系统发育障碍，并有其它潜在性致畸作用。此外，中药如破气行血，大寒大热，滑利沉降的药对母体和胎儿都可产生不良影响。应慎重使用。
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）抗肿瘤药如氨甲喋啶易引起流产和无脑、脑积水、腭裂等畸形，与它种抗癌药合用危险性更大。还有马利兰、苯丁酸氮芥、6一巯基嘌呤、环磷酰胺、去乙酰甲基水仙碱、癌宁、长春碱、乌拉坦及碘治疗或骨盆放射，都可引起胎儿畸形。
2）激素类于妊娠头3个月应用可使女性胎儿男性化;3个月后应用，可使女性胎儿生殖器暂时增大等。
3）抗糖尿病药。有报道甲磺丁脲和氯磺丙脲引起死胎、新生儿死亡、多发性畸形和兔唇。有人认为胰岛素也能引起畸形。
4）抗疟药乙胺嘧啶和氯奎可致胎儿耳聋、脑积水和四肢缺陷畸形;长期大量使用奎宁可造成死胎、先天性耳聋，是否造成畸形尚有分歧。
5）抗惊、镇静安定药，如苯妥因钠、去氧苯巴比妥、苯巴比妥都能引起胎儿兔唇和腭裂;氯丙嗪可引起视网膜病变;氟哌啶醇可引起四肢畸形，眠尔通、安定、利眠宁也可致畸胎。
6）抗抑郁药丙咪嗪可引起胎儿骨畸形和兔唇;苯丙胺可致心脏缺损、大血管异位及畸形足等。
7）抗凝血药双香豆素和华法令致胎儿出血、死亡或鼻骨发育不全。
8）四环素可引起手指畸形、先天性白内障、骨生长障碍、牙釉发育不全及囱隆起或死胎。此外，经动物试验药物致畸的还有链霉素、利福平、乙硫异烟胺、TMP、磺胺类药、安眠酮、乙醇、灭滴灵、安其敏、大剂量阿斯匹林、避孕药、甲状腺素、维生素A、烟碱和偶氮染料及味精等。
为防止药物诱发畸胎，在妊娠头3个月应避免使用上述药物;对新药致畸性尚未充分了解，一般也应避免使用。
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